距离东京三百公里外的凤凰岛上，发生了一起人员被马匹踩踏而死的事件，谁知却让杉下右京（水谷丰 饰）的老搭档神户尊（及川光博 饰）找上门来。原来这座私人小岛正提供给有自卫队背景的某民兵组织作为训练基地，而该组织似乎涉嫌制造生化武器。神户受警察厅次长甲斐峰秋（石坂浩二 饰）指派，命令杉下与搭档甲斐享（成宫宽贵 饰）以调查命案的名义前往凤凰岛，暗中侦查生化武器的证据。特命系二人组在民兵组织负责人神室司（伊原刚志 饰）的引导下来到事故现场，而杉下则察觉到这起意外背后似乎有着某种人为的因素存在。

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約14年ぶりに右京とタッグを組む薫は、曲がったことが嫌いで超が付くほどの熱血漢。ただ、お人好しで楽天的な性格が災いし、面倒事に巻き込まれたり、自らトラブルを引き起こすこともあった。論理的な右京とぶつかることも少なくなかったが、数々の事件を解決していくうちに強い信頼関係で結ばれていく。season7の第9話で、高校時代の友の死をきっかけに、彼の遺志を継いで子供たちに“正義”を教えるため、不正が蔓延する南アジアの小国・サルウィンに移住していた。

东京明和银行职员中山雄吾（户次重幸 饰）坠楼身亡，搜查一课刑警伊丹宪一（川原和久 饰）率队赶赴现场，结果遭遇了颇令他头疼的警视厅电脑犯罪对策课的专门搜查官岩月彬（田中圭 饰）。原来中山生前曾以Justice11的ID在网络上上传散布大量疑似银行内幕信息的数据，其行为早已引起岩月彬及其同僚的注意。伊丹和岩月逼近中山的上司朽木贞义（田口智朗 饰），对方闪烁其词的举止让他们觉察泄露的数据中藏着什么秘密。岩月故意将搜查二课引入搜查本部，后者对旁支线索的追查果然为本案打开局面。不久，明和银行的支付系统发生故障，引起不小的混乱，而奔赴在前线的刑警们也接到来自政府高层的中止调查的命令。

已是花甲之年的根本勋（伊武雅刀 饰）退休前曾是一名火车司机，在工作岗位上他尽职尽责，高度集中，也许正因为这份专著让他生活中不苟言笑，令人感觉难以靠近。如今他悠闲地待在家中，才发现自己原来住在一个临海的美丽地方，青年男女们冲浪嬉戏，自得其乐，而根本的心神却无处安置。这是一个闲散悠哉的午后，老婆敏子外出学习游泳，女儿和同学聚会，家中只留下根本以及从未露出笑容的外孙女，当然还有一群随时出现在任何角落的猫儿。

七年前，日本驻英领事馆发生了一起致命性的中毒事件，而唯一的幸存者也被国际犯罪组织劫走。出于政治原因，日本政府决定将此事隐瞒了下来。 七年后，前国际犯罪情报事务局理事马克·刘来到日本追查犯罪组织头目渡鸦的踪迹。东京警视厅派出特别干员杉下右京及冠城亘前往协助。然而，警方的第一个线人很快就被一个神秘的黑衣男子杀害。不久后犯罪组织入侵了外交部的官方网，并放出一段录像，在录像中的正是七年前失踪的幸存者，鹭泽瑛里佳。组织向日本政府索要9亿日元，并扬言如果不服从要求，数百万人将会见证日本的毁灭……

「season22」は、特命係が1人の女性に頼まれ、人探しを始めるところから幕を開ける。やがてその謎の人物は、日本を震撼させた重大事件とつながっていることが判明。特命係は危険な潜入捜査を行うが、事件の深層には巨大な陰謀が潜んでいた。