当年在努布拉岛营建侏罗纪公园时，约翰•哈蒙德（理查德•阿滕伯勒 Richard Attenborough 饰）曾把附近的索纳岛作为恐龙的制造工场。侏罗纪公园沦陷后，索纳岛上的恐龙在完全隔绝且缺少必要合成元素的情况下生存了4年时间。哈蒙德对此颇感好奇，他重新找到马科姆博士（杰夫•高布伦 Jeff Goldblum 饰），邀请他前往小岛考察。4年前经历让马科姆心有余悸，他断然拒绝哈蒙德的提议，但当得知女友莎拉（朱丽安•摩尔 Julianne Moore 饰）已前往小岛之时，只得跟随探险队整装出发。

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自从蒂姆在苏格兰体验了人生奇遇之后很多事情便接踵而来，他找到了亲生父亲，并且重建了他的家庭。在蒂姆的妈妈死于一场悲惨的交通事故的一年半后，他和他的父亲埃里克正计划着在夏天到来的前夕去婆罗洲旅行。