新的学期开始了，外表凶狠但内心纯良的少年高须龙儿（间岛淳司 配音）决心利用重新分班的机会一扫往日同学对他的误解。更让他高兴的是，自己即将和暗恋了一年有余的栉枝实乃梨（堀江由衣 配音）成为同班同学。除此之外，还有多年的死党北村祐作（野岛裕史 配音）陪伴，一段崭新的高中生活展现在了龙儿的眼前。少女逢坂大河（钉宫理惠 配音）的出现吸引了龙儿的目光，并不是因为此人傲娇腹黑的别扭个性，而是因为在偶然中，龙儿发现，大河居然暗恋着自己的好友祐作。

经过1800年的岁月洗礼，源自古老中国大陆的暗杀拳——北斗之拳终于迎来最强盛的时刻。掌门人琉泉收养的四位养子：拉奥、托奇、加基和健四郎经受住无数磨练，早已锻炼出强壮之躯。为了防止武功外泄，千百年来北斗之拳都严守着单子相传的铁规。面对四个强大的养子，琉泉最终选择更具悲悯之心的健四郎为继承人。这一决定，也导致了四兄弟的分道扬镳。与他们一同长起来的，还有自幼失去父母的尤莉亚。尤莉亚对健四郎心有所属，情愿与之绝走天涯。尤莉亚圣洁、美丽，不仅健四郎为之倾倒，拉奥、托奇甚至南斗水鸟拳的殉也深爱着她。也由此，这群末世英雄谱写了一段段悲壮感人的传奇诗篇……

愚蠢的人类被贪婪所驱使，按下了那枚摧毁文明的按钮。浩劫过后，人类世界退回到暴力血腥的原始阶段，而在这混乱的世道中，拉奥所统领的拳王军所向披靡。当初，拉奥作为大师兄，曾和健四郎一同学习北斗神拳。这个有着1800年历史的暗杀拳法，始终奉行着唯一继承人的准则。拉奥虽然实力雄厚，却始终缺乏健四郎的悲悯之心。当后者成为北斗神拳的继承人化身为救世主时，拉奥转而走上更为黑暗的道路。当拳王军的铁蹄已经统治这个国家之时，南斗自由军揭竿而起，并邀请健四郎一同对抗他的宿敌——拳王拉奥……

不幸的少年，高中生绫崎飒，为浪费无度的父母而被迫辛苦打工，怎知道借了1亿5000万日元高利贷的父母却逃之夭夭，用绫崎飒本人抵债。