宽永七年德川幕府第三代将军家光时，当时由于实施中央集权，削弱了许多诸侯大名的权力，曾经叱咤一时的武士阶级很多失业沦为浪人。残酷的现实使得无所事事的浪人经常跑到诸侯家，表示要切腹自杀，而势力被削弱无力招揽更多浪人的诸侯只得用钱打发他们走，于是这成为当时流行的敲诈手段。一天井伊家来了一位名叫千千岩求女的浪人，他也提出相同要求，家臣决定将计就计，让他切腹，结果千千岩求女在极度痛苦中咬舌死去。

异次元人亚波妄想侵占地球，炮制了一系列宇宙怪兽和地球生物合成的超兽。被称为第1号的超兽贝劳克恩在日本福山市登场。前去迎战的地球防卫军全军覆没。这时，在惨遭破坏的大街上，有二位把自己生命置之度外的青年，他们是面包房的驾驶员北斗星司和护士小姐南夕子。二人竭尽全力救援遇难的人们，但终于精疲力尽倒在瓦砾中……救了他俩的是艾斯·奥特曼。艾斯把自己的生命溶入了二人的体中。

犬神制药创始人犬神佐兵卫（三国连太郎 饰）一生不曾娶妻，却有三个女儿松子（高峰三枝子 饰）、竹子（三条美纪 饰）、梅子（草笛光子 饰），另收养恩人野野宫大式孙女珠世（岛田阳子 饰）为义女。犬神生前留有遗书，规定三女只能继承遗产极少部分，多数遗产由珠世获得，然珠世需同犬神三 个孙子中的一个婚配方可继承。犬神家顾问律师嗅到遗产之争背后的血腥气息，从东京请来名侦探金田一耕助（石坂浩二）协助调查。