在这个科技飞速发展的时代里，想要解读人类脑中残留的影像早已不是一件难题，一个专门利用此项技术侦破案件的组织——第九研究室应运而生。在室长薪刚（关智一 配音）的带领下，身强体壮的青木一行（浪川大辅 配音）、心理学者天地奈奈子（野中蓝 配音）等精明强干的队员们利用各自的能力破解着一桩又一桩扑朔迷离的案件。

高中生四月一日君寻（福山润 配音）有着令他十分困扰的灵异体质，他总是能在不知不觉的情况下吸引大量的灵体。一日，偶然中他踏进了一间魔法商店，遇见了美丽神秘的店主壹原郁子（大原沙耶香 配音）。郁子告诉他这是一件帮人达成愿望的商店，四月一日君寻遂许下了希望能解除特异体质的愿望，可是这愿望售价昂贵，四月一日君寻不得不在店里打工来付清欠款。此间，他结实了沉默寡言的白目鬼静（中井和哉 配音）、厄运缠身的九轩葵（伊藤静 配音），以及一只造型怪异的名叫魔可拿的宠物。

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高中毕业前最后的暑假，富樫勇太（福山润 饰）和小鸟游六花（内田真礼 饰）依然过着平静的生活，只是两人的关系似乎没有更进一步的苗头。在此期间，六花的姐姐十花在意大利找到工作，遂决定举家迁往海外。而面对重度中二病患者的妹妹——连上大学都成问题的六花，作为姐姐的十花无论如何不放心将她一个人留在日本。得知要和六花分开，勇太内心充满焦灼。